1940年,原浙西三中教师陈鸿文等人,提议创办昌化县立初级中学,昌化县长董中生确定以三民乡(今龙岗镇)为建校地址,主持召开校舍筹建联席会议。
1941年3月,根据浙江省教育厅批示,“昌化县立战时初中补习学校“成立。
1943年3月11日,浙江省教育厅以中字第777号文件,正式命名为“昌化初级中学”。
1944年,原附设在补习学校的昌化县师训班另立为昌化简易师范。
1945年6月,浙江省教育厅批准,昌化初中与简易师范合并。
1956年初,浙江省教育厅正式批准学校增设高中部,改校名为浙江省昌化中学。
1960年,学校更名为临安县昌化中学。
1970年初,校舍被工厂占用,迁来昌化与原武隆初中合并,仍称昌化中学。
1974年11月15日,杭州市革委会批准将校址迁往南塔岭。
1990年,撤销初中部,成为普通高级中学。1999年12月29日,省教委下文认定“昌化中学为省三级重点中学”。
1999年12月29日,省教委下文认定“昌化中学为省三级重点中学”。
2002年,浙江省昌化中学被评为浙江省省二级重点中学。
2005年1月,浙江省昌化中学被评为浙江省省一级重点中学。
截至2015年12月,浙江省昌化中学有教学楼、办公楼、图书馆、体艺馆、实验楼,并装备了现代化教学设施,女生公寓楼、学生第二食堂、塑胶田径场,在全部教室和学生公寓安装了空调。报告厅、微格教室、第三学生公寓建成、学校停车场、PU球场完工。