学校始建于1956年9月,当时定名为“吉安市初级中学”。1958年正式定名为“吉安市第三中学”,校址迁至吉安市跃进路42号。文革期间,学校几经迁移、拆并。1972年9月,重新回到现址,此时,学校已发展为规模较大的完全中学。2001年,该校进一步发展为“市级重点中学”,2002年该校被定为省重点建设学校。吉安三中创建于1956年,是吉安市城南唯一的一所市级重点中学,2009年被认定为江西省重点中学。
学校规划占地210余亩,其中校舍面积(不含教工宿舍)23000多平方米。校内林荫夹道,环境优美。学校具有教学楼、实验楼、学生公寓、食堂、图书室、语音室、微机房、多媒体教学系统,运动场等现代化教学生活设施。全校现有57个班,3000多学生。
仅近几年,教师在各级优课竞赛、说课比赛、教案比赛、电教课比赛中有100余人次获奖。学生在全国数、理、化知识竞赛中获全国二等奖60人次,三等奖196人次。连续四届全国中小学生电脑制作活动中,该校学生分别荣获全国一等奖2个,全国二等奖4个。